До своего назначения Тухтаев занимал должность советника министра иностранных дел Узбекистана. Он также работал в Институте стратегических и межрегиональных исследований при президенте, а также в Администрации президента Узбекистана.
Алишер Тухтаев сменил Ойбека Усманова, который возглавлял посольство Узбекистана в Пакистане с 2021 по 2024 годы.
