Ранее Мехриддин Абдуллаев работал первым заместителем председателя Счетной палаты Узбекистана.
Также он работал главным экономистом Жондорского отделения Центрального банка, занимал руководящие должности в ряде коммерческих банков, отделения Центрального банка, отдельных подразделений Министерства финансов, заместителя министра, а также первого заместителя хокима Бухарской области.